Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Klhdc3Q8VEM9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Klhdc3Q8VEM9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Klhdc3Q8VEM9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms