Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot6lQ8VEG6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnot6lQ8VEG6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot6lQ8VEG6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot6lQ8VEG6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot6lQ8VEG6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot6lQ8VEG6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot6lQ8VEG6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot6lQ8VEG6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms