Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lmcd1Q8VEE1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmcd1Q8VEE1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmcd1Q8VEE1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmcd1Q8VEE1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms