Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc115Q8VE99 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc115Q8VE99 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc115Q8VE99 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms