Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uhrf1Q8VDF2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf1Q8VDF2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uhrf1Q8VDF2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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