Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt25Q8VCW2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt25Q8VCW2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Krt25Q8VCW2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt25Q8VCW2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms