Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ubxn4Q8VCH8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubxn4Q8VCH8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ubxn4Q8VCH8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms