Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Dnajc28Q8VCE1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dnajc28Q8VCE1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms