Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kdm4cQ8VCD7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kdm4cQ8VCD7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm4cQ8VCD7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm4cQ8VCD7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms