Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBY2

Camkk1, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camkk1Q8VBY2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camkk1Q8VBY2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Camkk1Q8VBY2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Camkk1Q8VBY2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Camkk1Q8VBY2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Camkk1Q8VBY2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Camkk1Q8VBY2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Camkk1Q8VBY2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Camkk1Q8VBY2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms