Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nup35Q8R4R6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nup35Q8R4R6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms