Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trpm8Q8R4D5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Trpm8Q8R4D5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Trpm8Q8R4D5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpm8Q8R4D5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm8Q8R4D5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms