Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Vmn1r200Q8R281 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vmn1r200Q8R281 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmn1r200Q8R281 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms