Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gga1Q8R0H9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gga1Q8R0H9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gga1Q8R0H9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms