Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pof1bQ8K4L4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pof1bQ8K4L4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms