Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MyripQ8K3I4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MyripQ8K3I4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MyripQ8K3I4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms