Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Stn1Q8K2X3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Stn1Q8K2X3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stn1Q8K2X3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms