Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FntbQ8K2I1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FntbQ8K2I1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FntbQ8K2I1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FntbQ8K2I1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.1 ms