Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Colgalt1Q8K297 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Colgalt1Q8K297 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Colgalt1Q8K297 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms