Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtmr3Q8K296 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mtmr3Q8K296 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mtmr3Q8K296 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtmr3Q8K296 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms