Protein–RNA interactions for Protein: Q8K259

Gin1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gin1Q8K259 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gin1Q8K259 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gin1Q8K259 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gin1Q8K259 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gin1Q8K259 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gin1Q8K259 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gin1Q8K259 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gin1Q8K259 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gin1Q8K259 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gin1Q8K259 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gin1Q8K259 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gin1Q8K259 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gin1Q8K259 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms