Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nek9Q8K1R7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nek9Q8K1R7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek9Q8K1R7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms