Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2-Q4Q8HWB2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2-Q4Q8HWB2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2-Q4Q8HWB2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms