Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LgsnQ8CIX8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LgsnQ8CIX8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LgsnQ8CIX8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms