Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CherpQ8CGZ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CherpQ8CGZ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CherpQ8CGZ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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