Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGM2

Rp1l1, Retinitis pigmentosa 1-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1l1Q8CGM2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rp1l1Q8CGM2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rp1l1Q8CGM2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rp1l1Q8CGM2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms