Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2bQ8CFI7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2bQ8CFI7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2bQ8CFI7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms