Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6030452D12RikQ8CD33 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
6030452D12RikQ8CD33 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
6030452D12RikQ8CD33 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms