Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Riox2Q8CD15 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Riox2Q8CD15 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Riox2Q8CD15 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms