Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf31Q8CCF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf31Q8CCF0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prpf31Q8CCF0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prpf31Q8CCF0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms