Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Atg16l1Q8C0J2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Atg16l1Q8C0J2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atg16l1Q8C0J2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms