Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXV2

Bri3bp, BRI3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bri3bpQ8BXV2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bri3bpQ8BXV2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bri3bpQ8BXV2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bri3bpQ8BXV2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bri3bpQ8BXV2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bri3bpQ8BXV2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bri3bpQ8BXV2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bri3bpQ8BXV2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bri3bpQ8BXV2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bri3bpQ8BXV2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bri3bpQ8BXV2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bri3bpQ8BXV2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms