Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX51

Sgcz, Zeta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgczQ8BX51 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SgczQ8BX51 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SgczQ8BX51 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SgczQ8BX51 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms