Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbbp5Q8BX09 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbbp5Q8BX09 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbbp5Q8BX09 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbbp5Q8BX09 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms