Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dclk3Q8BWQ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclk3Q8BWQ5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclk3Q8BWQ5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310.3 ms