Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP2

Ldhal6b, L-lactate dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldhal6bQ8BVP2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldhal6bQ8BVP2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldhal6bQ8BVP2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ldhal6bQ8BVP2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldhal6bQ8BVP2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldhal6bQ8BVP2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldhal6bQ8BVP2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldhal6bQ8BVP2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldhal6bQ8BVP2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ldhal6bQ8BVP2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ldhal6bQ8BVP2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ldhal6bQ8BVP2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ldhal6bQ8BVP2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldhal6bQ8BVP2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldhal6bQ8BVP2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ldhal6bQ8BVP2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldhal6bQ8BVP2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ldhal6bQ8BVP2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms