Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Triml1Q8BVP1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Triml1Q8BVP1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Triml1Q8BVP1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms