Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp4aQ8BU40 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp4aQ8BU40 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp4aQ8BU40 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4aQ8BU40 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4aQ8BU40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4aQ8BU40 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4aQ8BU40 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4aQ8BU40 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4aQ8BU40 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp4aQ8BU40 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms