Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Suds3Q8BR65 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Suds3Q8BR65 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Suds3Q8BR65 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms