Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AtripQ8BMG1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AtripQ8BMG1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AtripQ8BMG1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms