Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan12Q8BKT6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan12Q8BKT6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tspan12Q8BKT6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms