Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIH0

Sap130, Histone deacetylase complex subunit SAP130, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap130Q8BIH0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sap130Q8BIH0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sap130Q8BIH0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sap130Q8BIH0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms