Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Susd4Q8BH32 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Susd4Q8BH32 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Susd4Q8BH32 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Susd4Q8BH32 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms