Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubash3bQ8BGG7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubash3bQ8BGG7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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