Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnpo1Q8BFY9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnpo1Q8BFY9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnpo1Q8BFY9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms