Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfascQ810U3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NfascQ810U3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfascQ810U3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NfascQ810U3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfascQ810U3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfascQ810U3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfascQ810U3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NfascQ810U3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfascQ810U3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NfascQ810U3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NfascQ810U3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfascQ810U3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NfascQ810U3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NfascQ810U3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NfascQ810U3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfascQ810U3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NfascQ810U3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfascQ810U3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NfascQ810U3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NfascQ810U3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NfascQ810U3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfascQ810U3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfascQ810U3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NfascQ810U3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfascQ810U3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfascQ810U3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfascQ810U3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NfascQ810U3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NfascQ810U3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfascQ810U3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NfascQ810U3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfascQ810U3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfascQ810U3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NfascQ810U3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfascQ810U3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfascQ810U3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NfascQ810U3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NfascQ810U3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfascQ810U3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfascQ810U3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms