Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc172Q810N9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc172Q810N9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc172Q810N9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms