Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS7

BC048507, MCG49550, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048507Q80ZS7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BC048507Q80ZS7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BC048507Q80ZS7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BC048507Q80ZS7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms