Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nrde2Q80XC6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrde2Q80XC6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrde2Q80XC6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms