Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
WhrnQ80VW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WhrnQ80VW5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WhrnQ80VW5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
WhrnQ80VW5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms